办理入臺证於两个月前申请，因大陆地区的人民，收到入臺证后尚须持此证办理大陆地区居民往来臺湾通行证(大通证)，大通证办理时间应约一个月，且须保留相关文件作业时间，故宜儘早申请。
- 进入「」网站，登入帐号。
- 选择「线上申办」&谤补谤谤;「专业申请资料匯入」
- 選擇申請事由，並輸入預定入境與出境日期（注意！請依照「活动計畫書及行程表」所寫行程填入，否則會退件），匯入資料時請保持範本格式無誤，修改格式會導致上傳失敗（請使用「入臺證批次上傳表.xls」）
- 确认申请资料上传完毕后，由「线上申请」&谤补谤谤;「专业人士参访申请」&谤补谤谤;「案件瀏览」进入，填写送件人资料（送件人即為系所承办人），之后便可逐一上传、填写团员资料（请使用「入臺证线上申请表.虫濒蝉虫」索取来臺人士之完整资料）
如出現「目前系統流量過多，請稍候再試」則為上傳失敗，請見「常见问题」中「资料送件」，检查上传档案是否有误。
- 以短期交流為例，填妥資料後須上傳委託書、保證書及活动計畫書及行程表。
注意！预定出入境时间需与行程表相符，上传档案只接受图档（瀏览&谤补谤谤;选择档案，无须按扫描），档案完整后按「下一步并储存本页」
- 点选「编辑团员名册」，请一一确认团员名册填写无误，并於需检附文件处上传「居民身分证影本」，「相关专业造诣或职务证明」请上传如：在学证明、入学许可、邀请函等证明文件。
如為居住在第叁地之人士(含港、澳、国外)，无论是否為大陆地区所发护照，在「证照资料」栏位皆需填写护照号码。
若資料尚未齊全，請選擇「資料暫存」；填寫完整請選擇「資料儲存」，如果網頁仍停留在资料填写頁面，代表仍有資料未填寫完成，系統將以紅字標註未完成項目。(建議填寫過程中可多次暫存資料，以免畫面停留過久，系統在按下按鈕時會自動返回首頁，導致資料遺失)
- 确认「资料完成度」皆為「佳」即可送出申请。
- 送出申请需认证自然人凭证。〈系统会直接跳转〉
若没有出现「登入」按钮，请参见「常用问题」按照步骤解决，即可登入。
- 登入后无需进行「申请成為会员」等动作，只要回到申请网页，於「优先处理事项」区，出现如下图「身分审核中」字样，即為成功送出。
